1977年9月10日,，中國(guó)科學(xué)院向國(guó)務(wù)院報(bào)送了《關(guān)于招收研究生的請(qǐng)示報(bào)告》,，提出委托中國(guó)科技大學(xué)在京區(qū)各所的大力協(xié)作下在北京籌辦研究生院。月底,，報(bào)告獲得批準(zhǔn),，國(guó)家決定在中國(guó)科學(xué)院所屬的66個(gè)研究所和四所大學(xué)恢復(fù)研究生制度。11月3日,，經(jīng)國(guó)務(wù)院批準(zhǔn),，中國(guó)科學(xué)院與教育部聯(lián)合發(fā)出《關(guān)于一九七七年招收研究生具體辦法的通知》，標(biāo)志著我國(guó)研究生教育制度中止了12年之后的恢復(fù),。
1977年12月19日,，中國(guó)科學(xué)院批復(fù)同意研究生院機(jī)構(gòu)設(shè)置和人員編制。1978年3月1日,，中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)研究生院在北京正式成立,。3月31日，國(guó)務(wù)院批復(fù)中國(guó)科學(xué)院,，同意嚴(yán)濟(jì)慈任中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)研究生院院長(zhǎng),，馬西林等任副院長(zhǎng)。研究生院于1978年10月14日舉行開學(xué)典禮。
研究生院設(shè)有數(shù)學(xué),、物理,、化學(xué)、天文,、地學(xué),、生物學(xué)、無線電技術(shù),、計(jì)算機(jī)工程,、空間技術(shù)、環(huán)境科學(xué)以及科學(xué)組織管理等專業(yè),。中國(guó)科學(xué)院的73個(gè)研究所與208所高校及中國(guó)社科院,、部委所屬89個(gè)單位，于1978年招收了恢復(fù)研究生教育后的第一批研究生,。1978年,，中國(guó)科學(xué)院共招收研究生1400名，從中選擇數(shù),、理,、化、專業(yè)課和外語課基礎(chǔ)較好的170人,，準(zhǔn)備出國(guó)留學(xué),。
1980年，五屆人大常委會(huì)第13次會(huì)議通過《中華人民共和國(guó)學(xué)位條例》,，學(xué)位條例規(guī)定“碩士學(xué)位,、博士學(xué)位，由國(guó)務(wù)院授權(quán)的高等學(xué)校和科學(xué)研究機(jī)構(gòu)授予”,，以立法的形式確立了中國(guó)的研究生教育是由高等學(xué)校和科學(xué)研究機(jī)構(gòu)共同進(jìn)行,。首任國(guó)務(wù)院學(xué)位委員會(huì)主任由時(shí)任中國(guó)科學(xué)院院長(zhǎng)的方毅出任。
1981年5月20日,，國(guó)務(wù)院批準(zhǔn)實(shí)施《中華人民共和國(guó)學(xué)位條例暫行實(shí)施辦法》,。
1983年5月27日，國(guó)務(wù)院學(xué)位委員會(huì)和北京市人民政府在人民大會(huì)堂聯(lián)合召開博士,、碩士學(xué)位授予大會(huì),，共授予新中國(guó)首批18人博士學(xué)位，其中馬中騏（高能物理研究所）,、謝惠民（系統(tǒng)科學(xué)研究所）,、馮玉琳（計(jì)算技術(shù)研究所）、黃朝商（理論物理研究所）,、徐功巧（生物物理研究所）、徐文耀（地球物理研究所）6人來自研究生院。
1980年1月16日,，嚴(yán)濟(jì)慈同意李政道在美國(guó)同各大學(xué)聯(lián)系招考研究生時(shí),，使用“中國(guó)科學(xué)院研究生院”名稱。1982年,，中國(guó)科學(xué)院黨組批準(zhǔn)研究生院在對(duì)外交流中,，同時(shí)使用“中國(guó)科學(xué)院研究生院”和“中國(guó)科技大學(xué)研究生院”的名稱。1986年10月,，中國(guó)科技大學(xué)研究生院（合肥）成立,。
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